Responsável atualmente pela educação de estudantes do Ensino Médio, Fundamental 2 e EJA Noturno, a história da instituição centenária é rica e acolheu em seus bancos no período milhares de estudantes.
Sua história começa no governo fluminense de Raul de Moraes Veiga, quando foi inaugurado no ano de 1922, com o nome de Escola Profissional “Nilo Peçanha”. No entanto, somente abriu suas portas no governo Feliciano de Abreu Sodré em 1923, com um currículo distribuído em 03 (três) anos para ministrar instrução à juventude feminina. Em 1926, formou-se a primeira turma com 32 alunos.
Com a reforma do Ensino Profissional, em 20 de janeiro de 1936, os cursos passaram a funcionar com os nomes de Fundamental, Profissional e Normal-Profissional (este não chegando a funcionar), de acordo com a Resolução do Decreto No. 129, assinado pelo governador Almirante Protógenes Pereira Guimarães. Foi só em 1974 que foi criado 2º. Grau, hoje Ensino Médio. Já em 1977, sua denominação mudou para Colégio Estadual “Nilo Peçanha”.